メンバー
スタッフ
| 機構長、物理学専攻 教授 | 常行 真司 （兼務） |
| 教授 | 小芦 雅斗 （兼務） |
| 特任研究員（前機構長） | 三尾 典克 |
| 特任教授 | 仙場 浩一 |
| 特任教授 | 田丸 博晴 |
| 准教授 | 井手口 拓郎 |
| 准教授 | 小西 邦昭 |
| 准教授 | 相川 清隆 （兼務） |
| 助教 | 森田 悠介 |
| 助教 | 櫻井 治之 |
| 助教 | 橋本 和樹 |
| 特任助教 | 戸田 圭一郎 |
| 特任研究員、名誉教授 | 五神 真 （名誉教授） |
| 特任研究員、特命教授・名誉教授 | 湯本 潤司 （名誉教授・特命教授） |
| 特任研究員、名誉教授 | 清水 明 （名誉教授） |
| 特任研究員 | 永妻 忠夫 |
| 特任研究員 | 伊藤 弘 |
| 特任研究員 | 添田 建太郎 |
| 特任研究員 | 長沼 和則 |
| 特任研究員 | 山口 義紀 |
| 特任研究員 | 的場 みづほ |
| 特任研究員 | 川野 将太郎 |
| 特任研究員 | 森下 裕介 |
| 特任研究員 | 高塚 肇 |
| 特任研究員 | 米窪 博祐 |
| 学振特別研究員 | 徐 自聡 |
| 派遣研究員 | 横堀 秀一 |
| 客員共同研究員 | 何 亜倫 (HO Ya-lun) (物材機構・主任研究員) |
| 客員共同研究員 | 成島 哲也 |
| 客員共同研究員 | 石田 行章 (理化学研究所・研究員) |
| 学術専門職員 | 生津 英夫 |
| 学術専門職員 | 荻窪 徳 |
| 学術専門職員 | 田中 麻美 |
| 高度学術員 | 白濱 昌子 |
| 主事員 | 大島 茜 |
| 主事員 | 三浦 真帆 |
| 特任専門職員 | 内海 のり子 |
| 特任専門職員 | 数原 基子 |
| 連携組織も参照ください 光量子科学研究センター 光量子科学連携研究機構 |
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| 2025.4 現在 |
運営委員会
| 委員長 常行 真司（フォトンサイエンス研究機構 機構長、物理学専攻 教授） |
| 佐藤 薫（理学系研究科副研究科長、地球惑星科学専攻 教授） |
| 松尾 泰（物理学専攻 専攻長・教授） |
| 岡田 康志（物理学専攻 教授） |
| 小澤 岳昌（化学専攻 教授） |
| 小芦 雅斗（工学系研究科附属光量子科学研究センター センター長・教授、光量子科学連携研究機構 機構長） |
| 島野 亮（低温科学研究センター センター長・教授） |
